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DeepLabCut: a deep learning tool for fast, robust, and efficient 3D pose estimation of multiple individuals

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Quantifying behavior is crucial for many applications across the life sciences and engineering. Videography provides easy methods for the observation and recording of animal behavior in diverse settings, yet extracting particular aspects of a behavior for further analysis can be highly time consuming and computationally challenging. I will present an efficient method for markerless pose estimation based on transfer learning with deep neural networks that achieves excellent results with minimal training data. I will demonstrate the versatility of this framework by tracking various body parts in multiple species across a broad collection of behaviors from egg-laying fruits flies to hunting cheetahs. Furthermore, I will highlight recent work on tracking multiple animals during social and collective behaviors as well as ways to score their behavior automatically.

Referent/-in

Alexander Mathis (lab of Prof. Venkatesh N. Murthy)
Department of Molecular and Cellular Biology at Harvard University

Anfahrtswege zum DPZ

Lageplan des DPZ

E - Haupteingang/Anmeldung
1 - Geschäftsführung; Abteilungen: Infektionsbiologie/-modelle, Versuchstierkunde, Primatengenetik, Verhaltensökologie und Soziobiologie, Kognitive Ethologie, Neurobiologie; Verwaltung; Bibliothek; Stabsstellen: Forschungskoordination, Kommunikation, Informationstechnologie, Betriebstechnik
2 - Materialanlieferung/Einkauf
3 - Forschungsplattform Degenerative Erkrankungen; Forschungsgruppe Soziale Evolution der Primaten
4 - Abteilung Kognitive Neurowissenschaften
5 - Tierhaltung
6 - Bildgebungszentrum; Abteilung Funktionelle Bildgebung


Anreise mit dem PKW

Folgen Sie von der Autobahnausfahrt "Göttingen Nord" der B27 in Richtung Braunlage bis zur dritten Ampelkreuzung. Biegen Sie rechts ab Richtung Kliniken und anschließend links in die Robert-Koch-Straße. Am Ende der Straße fahren Sie rechts in Richtung Nikolausberg auf die Otto-Hahn-Straße. Die erste Straße zu Ihrer Linken ist der Kellnerweg, das Primatenzentrum ist ausgeschildert.


Anreise mit dem Bus

Ihr Fußweg von der Bushaltestelle Kellnerweg zum DPZ-Haupteingang/zur Anmeldung:
Von der Bushaltestelle Kellnerweg (Linie 21/22 und 23) Straße überqueren, in Fahrtrichtung des Busses gehen. Am Briefkasen links in den Fußweg einbiegen und rechts halten. Am Ende des Fußwegs rechts in den Kellnerweg abbiegen. Der Haupteingang des DPZ liegt dann auf der linken Seite.

Datum und Uhrzeit 10.09.19 - 16:15 - 17:15 Anmeldung nicht notwendig

Veranstaltungsort Alter Hörsaal/Old Lecture Hall

Veranstalter

Deutsches Primatenzentrum GmbH

Kellnerweg 4

37077 Göttingen

Kontakt

Julia Wanda Nowak, M.Sc.

PhD Student

Cognitive Neuroscience Laboratory - Sensorimotor Group

Tel: +49 (0) 551 38 51 360

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