Vergleichende phylogenetische Methoden werden häufig genutzt um die Evolution von Merkmalen, u.a. auch Verhaltensmerkmalen, zu untersuchen. Ein fundamentaler erster Schritt hierzu ist die Rekonstruktion einer zuverlässigen Phylogenie, die als Rahmen für phylogenetische Analysen von Merkmalen und Anpassungen dient. Molekulargenetische Methoden sind hier hilfreiche Werkzeuge. Diese Werkzeuge setzen wir auch bei populationsgenetischen Studien ein, denn Gene sind nicht nur ein Faktor, der Verhalten mitbestimmt, sondern Verhalten beeinflusst auch die genetische Struktur von Populationen und damit ihre genetische Diversität. Genetische Variation ist wiederum Ausgangsmaterial für weitere Evolutionsprozesse.